В институте работают пять архитектурно-планировочных мастерских (АПМ), во главе которых стоят уважаемые в профессиональной среде архитекторы и проектировщики - Эбель В.В., Чередниченко В.В., Дудкина Е.В., Семушкин В.В., Каньшина О.М. За 60-летнюю историю специалисты института запроектировали свыше 6000 объектов жилищно-гражданского назначения.

Комплексный подход к проектированию зданий и сооружений I и II уровней ответственности основывается на соответствии государственным стандартам и включает следующие виды работ:

• Разработка проектно-сметной документации;
• Эскизный проект;
• Архитектурно-градостроительное решение;
• Стадии "проект", "рабочий проект", "рабочая документация";
• Сводные сметные расчеты;
• Локальные сметы;
• Компьютерное моделирование и 3D визуализация проектных решений;
• Дизайнпроекты интерьеров жилых и общественных зданий;
• Авторский надзор;
• Сопровождение исходно-разрешительной документации;
• Сопровождение проекта при экспертизе и согласовании на всех этапах

Разработка проектов ведётся в современных компьютерных форматах, что позволяет повысить качество концептуальных и эскизных проработок, сокращает сроки разработки рабочей документации. В институте внедрена система комплексного проектирования в единой программной среде Autodesk Architectural Desktop 2007.

Жилые дома и административные здания, школы и детские сады, поликлиники и спортивные центры, православные храмы и мечети построены по разработанным в ОАО ПИ "НОВОСИБГРАЖДАНПРОЕКТ" проектам не только в Новосибирске и Новосибирской области, но и Республике Саха, Ямало - Ненецком АО, Кемеровской, Томской, Иркутской и Тюменской областях и других регионах России.